Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Eif3aP23116 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eif3aP23116 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eif3aP23116 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eif3aP23116 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eif3aP23116 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eif3aP23116 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eif3aP23116 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eif3aP23116 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eif3aP23116 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eif3aP23116 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eif3aP23116 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eif3aP23116 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eif3aP23116 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eif3aP23116 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Eif3aP23116 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms