Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prim1P20664 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prim1P20664 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prim1P20664 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prim1P20664 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prim1P20664 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prim1P20664 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prim1P20664 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prim1P20664 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prim1P20664 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prim1P20664 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prim1P20664 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prim1P20664 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prim1P20664 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prim1P20664 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prim1P20664 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prim1P20664 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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Prim1P20664 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Prim1P20664 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prim1P20664 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
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Prim1P20664 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prim1P20664 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prim1P20664 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prim1P20664 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prim1P20664 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prim1P20664 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prim1P20664 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
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Prim1P20664 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Prim1P20664 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Prim1P20664 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prim1P20664 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prim1P20664 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Prim1P20664 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prim1P20664 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Prim1P20664 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Prim1P20664 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Prim1P20664 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prim1P20664 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms