Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ifrd1P19182 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifrd1P19182 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifrd1P19182 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifrd1P19182 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifrd1P19182 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifrd1P19182 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ifrd1P19182 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ifrd1P19182 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms