Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P18529 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P18529 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms