Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb1P17919 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Hoxb1P17919 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Hoxb1P17919 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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