Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gtf2i-223ENSMUST00000174513 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sptan1P16546 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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