Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Vpreb2P13373 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms