Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Dab2-202ENSMUST00000080880 4663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Sfxn2-201ENSMUST00000026011 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Mapkap1-203ENSMUST00000113126 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Abcc3-206ENSMUST00000178136 5005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms