Protein–RNA interactions for Protein: P11835

Itgb2, Integrin beta-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb2P11835 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Itgb2P11835 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Itgb2P11835 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms