Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P10404 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P10404 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P10404 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
P10404 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P10404 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P10404 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P10404 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
P10404 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P10404 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
P10404 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
P10404 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P10404 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P10404 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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P10404 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P10404 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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P10404 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
P10404 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
P10404 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P10404 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P10404 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
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P10404 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P10404 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P10404 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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P10404 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P10404 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P10404 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P10404 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P10404 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P10404 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
P10404 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P10404 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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P10404 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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P10404 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
P10404 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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P10404 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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P10404 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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P10404 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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P10404 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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P10404 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
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P10404 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
P10404 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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