Protein–RNA interactions for Protein: P10078

Zfp28, Zinc finger protein 28, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp28P10078 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Zfp28P10078 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Zfp28P10078 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Zfp28P10078 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Zfp28P10078 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Zfp28P10078 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp28P10078 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Zfp28P10078 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Zfp28P10078 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Zfp28P10078 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Zfp28P10078 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp28P10078 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Zfp28P10078 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp28P10078 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Zfp28P10078 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp28P10078 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp28P10078 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp28P10078 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp28P10078 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp28P10078 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp28P10078 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp28P10078 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Zfp28P10078 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Zfp28P10078 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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