Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RaxO35602 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RaxO35602 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RaxO35602 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RaxO35602 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RaxO35602 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RaxO35602 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RaxO35602 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RaxO35602 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RaxO35602 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RaxO35602 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RaxO35602 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RaxO35602 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RaxO35602 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RaxO35602 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RaxO35602 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RaxO35602 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RaxO35602 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RaxO35602 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RaxO35602 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RaxO35602 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RaxO35602 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RaxO35602 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RaxO35602 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RaxO35602 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RaxO35602 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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