Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Edil3O35474 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Edil3O35474 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Edil3O35474 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Edil3O35474 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Edil3O35474 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Edil3O35474 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Edil3O35474 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Edil3O35474 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edil3O35474 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edil3O35474 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edil3O35474 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edil3O35474 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Edil3O35474 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms