Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Atf6bO35451 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atf6bO35451 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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