Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gbp6-201ENSMUST00000196520 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 AC133598.5-201ENSMUST00000224937 1517 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gucd1-202ENSMUST00000118936 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm44951-201ENSMUST00000206449 2024 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Zfp189-201ENSMUST00000042964 2835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Eif2d-201ENSMUST00000068791 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Adgrl2-203ENSMUST00000168352 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Klf8-201ENSMUST00000039545 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm6185-202ENSMUST00000212885 2692 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Olfm4-203ENSMUST00000228749 2801 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm10754-202ENSMUST00000220233 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Zfp61-201ENSMUST00000077780 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Phka2-201ENSMUST00000033652 4133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Adgrf4-201ENSMUST00000024711 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Klhl20-201ENSMUST00000111611 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Tpm1-213ENSMUST00000113697 1742 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Prrg1-202ENSMUST00000114025 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms