Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Gm17577J3QNF7 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms