Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Bbip1J3QMK2 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms