Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm8005F6YKY3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm8005F6YKY3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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