Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17555F6U8B9 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Gm17555F6U8B9 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Gm17555F6U8B9 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Gm17555F6U8B9 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Gm17555F6U8B9 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Gm17555F6U8B9 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Gm17555F6U8B9 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Gm17555F6U8B9 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Gm17555F6U8B9 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17555F6U8B9 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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