Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ppip5k1-204ENSMUST00000110627 5494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Fgf6-201ENSMUST00000000187 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Itga10-201ENSMUST00000029744 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Setd7-201ENSMUST00000037141 7411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 585.3 ms