Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Phf11bB4XVQ1 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf11bB4XVQ1 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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