Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PtprbB2RU80 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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