Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Zbed5B2RPU8 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Zbed5B2RPU8 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Zbed5B2RPU8 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Zbed5B2RPU8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Zbed5B2RPU8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Zbed5B2RPU8 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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Zbed5B2RPU8 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Zbed5B2RPU8 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Zbed5B2RPU8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Zbed5B2RPU8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Zbed5B2RPU8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Zbed5B2RPU8 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Zbed5B2RPU8 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Zbed5B2RPU8 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Zbed5B2RPU8 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Zbed5B2RPU8 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Zbed5B2RPU8 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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