Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Gm6880A3KG45 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Gm6880A3KG45 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Gm6880A3KG45 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Gm6880A3KG45 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Gm6880A3KG45 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Gm6880A3KG45 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Gm6880A3KG45 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6880A3KG45 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
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