Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Syndig1A2ANU3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms