Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Lcn6A2AJB9 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Lcn6A2AJB9 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Lcn6A2AJB9 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Lcn6A2AJB9 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Lcn6A2AJB9 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Lcn6A2AJB9 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Lcn6A2AJB9 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Lcn6A2AJB9 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Lcn6A2AJB9 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Lcn6A2AJB9 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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Lcn6A2AJB9 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lcn6A2AJB9 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.5 ms