Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm5538W4VSP6 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5538W4VSP6 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5538W4VSP6 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5538W4VSP6 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5538W4VSP6 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5538W4VSP6 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5538W4VSP6 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5538W4VSP6 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5538W4VSP6 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5538W4VSP6 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5538W4VSP6 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5538W4VSP6 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5538W4VSP6 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5538W4VSP6 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5538W4VSP6 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5538W4VSP6 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5538W4VSP6 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5538W4VSP6 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5538W4VSP6 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5538W4VSP6 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5538W4VSP6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5538W4VSP6 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5538W4VSP6 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5538W4VSP6 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm5538W4VSP6 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms