Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm3550W4VSN7 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms