Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

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Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Hdac5Q9Z2V6 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Hdac5Q9Z2V6 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Hdac5Q9Z2V6 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Hdac5Q9Z2V6 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Hdac5Q9Z2V6 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Hdac5Q9Z2V6 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Hdac5Q9Z2V6 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdac5Q9Z2V6 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Hdac5Q9Z2V6 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Hdac5Q9Z2V6 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Hdac5Q9Z2V6 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Hdac5Q9Z2V6 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Gm44146-201ENSMUST00000203508 816 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdac5Q9Z2V6 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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