Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Rorc-201ENSMUST00000029795 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Mitf-202ENSMUST00000043637 4881 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Rimbp2-201ENSMUST00000111346 4264 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Mef2a-204ENSMUST00000107476 4759 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Ilf3-213ENSMUST00000216892 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm9860-201ENSMUST00000211426 3653 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Prdm1-204ENSMUST00000218369 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Mov10-207ENSMUST00000168015 3460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Mov10-201ENSMUST00000002297 3498 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Ptrh2-202ENSMUST00000108022 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Fcamr-201ENSMUST00000027670 1743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Rdh9-201ENSMUST00000052652 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tsc22d3Q9Z2S7 Mrpl51-201ENSMUST00000032485 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms