Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn13Q9Z0S4 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn13Q9Z0S4 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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