Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nme3Q9WV85 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms