Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tgm1Q9JLF6 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Tgm1Q9JLF6 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Tgm1Q9JLF6 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Tgm1Q9JLF6 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Tgm1Q9JLF6 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Tgm1Q9JLF6 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Tgm1Q9JLF6 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Tgm1Q9JLF6 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Tgm1Q9JLF6 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tgm1Q9JLF6 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Tgm1Q9JLF6 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tgm1Q9JLF6 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Tgm1Q9JLF6 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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