Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gde1Q9JL56 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms