Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn5Q9JL35 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms