Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Smg9Q9DB90 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Smg9Q9DB90 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms