Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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Subh2bvQ9D9Z7 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Subh2bvQ9D9Z7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Subh2bvQ9D9Z7 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Subh2bvQ9D9Z7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Subh2bvQ9D9Z7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Subh2bvQ9D9Z7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Subh2bvQ9D9Z7 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Subh2bvQ9D9Z7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Subh2bvQ9D9Z7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Subh2bvQ9D9Z7 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Subh2bvQ9D9Z7 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Subh2bvQ9D9Z7 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Subh2bvQ9D9Z7 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Subh2bvQ9D9Z7 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Subh2bvQ9D9Z7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Subh2bvQ9D9Z7 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Subh2bvQ9D9Z7 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Subh2bvQ9D9Z7 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Subh2bvQ9D9Z7 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms