Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Derl3Q9D8K3 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Derl3Q9D8K3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Derl3Q9D8K3 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Derl3Q9D8K3 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms