Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Cldn22Q9D7U6 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Cldn22Q9D7U6 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Cldn22Q9D7U6 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn22Q9D7U6 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn22Q9D7U6 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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