Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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Snx29Q9D3S3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Snx29Q9D3S3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Snx29Q9D3S3 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Snx29Q9D3S3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Snx29Q9D3S3 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Snx29Q9D3S3 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Snx29Q9D3S3 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Snx29Q9D3S3 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx29Q9D3S3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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