Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Upk1aQ9D132 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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