Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Zbed3Q9D0L1 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Zbed3Q9D0L1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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Zbed3Q9D0L1 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Zbed3Q9D0L1 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Zbed3Q9D0L1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Zbed3Q9D0L1 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Zbed3Q9D0L1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Zbed3Q9D0L1 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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