Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
NubplQ9CWD8 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms