Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snw1Q9CSN1 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms