Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Higd2aQ9CQJ1 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms