Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ39

Med21, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med21Q9CQ39 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Med21Q9CQ39 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Med21Q9CQ39 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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Med21Q9CQ39 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Med21Q9CQ39 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Med21Q9CQ39 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Med21Q9CQ39 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med21Q9CQ39 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Med21Q9CQ39 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Med21Q9CQ39 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med21Q9CQ39 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med21Q9CQ39 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med21Q9CQ39 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Med21Q9CQ39 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Med21Q9CQ39 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Med21Q9CQ39 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med21Q9CQ39 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Med21Q9CQ39 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med21Q9CQ39 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Med21Q9CQ39 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Med21Q9CQ39 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Med21Q9CQ39 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Med21Q9CQ39 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Med21Q9CQ39 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Med21Q9CQ39 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Med21Q9CQ39 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Med21Q9CQ39 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Med21Q9CQ39 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Med21Q9CQ39 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Med21Q9CQ39 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Med21Q9CQ39 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Med21Q9CQ39 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Med21Q9CQ39 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Med21Q9CQ39 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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