Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Chmp3Q9CQ10 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
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