Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atg3Q9CPX6 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg3Q9CPX6 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms