Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim26Q99PN3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim26Q99PN3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms