Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SrrtQ99MR6 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrrtQ99MR6 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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